More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7307 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
266 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  70.59 
 
 
266 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  68.24 
 
 
260 aa  329  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  63.08 
 
 
263 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  60.08 
 
 
282 aa  319  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  63.71 
 
 
289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  61.81 
 
 
267 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  61.81 
 
 
290 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  56.11 
 
 
263 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  55.81 
 
 
267 aa  269  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  58.43 
 
 
262 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32750  transcriptional regulator, DeoR family  55.43 
 
 
261 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19583  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  54.03 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  52.65 
 
 
265 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  48.68 
 
 
264 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3470  transcriptional regulator, DeoR family  50.21 
 
 
266 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  42.98 
 
 
266 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
267 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  39.47 
 
 
237 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  41.67 
 
 
258 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  33.47 
 
 
254 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.18 
 
 
250 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 
257 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  34.11 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  41.41 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.68 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  34.3 
 
 
255 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
253 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  38.06 
 
 
262 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
274 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
258 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
256 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  37.77 
 
 
256 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  32.3 
 
 
254 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  41.15 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.31 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  39.76 
 
 
253 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 
269 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.75 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
256 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.92 
 
 
260 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
260 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
264 aa  135  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.83 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  35.83 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.93 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
257 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  35.27 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  42.5 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  38.87 
 
 
261 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 
253 aa  132  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  34.71 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 
264 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  33.33 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  33.33 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  31.78 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  32.33 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
254 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 
253 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  34.3 
 
 
254 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 
253 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  34.98 
 
 
250 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.36 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.36 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.5 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  32.69 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.36 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.36 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.36 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.36 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  38.17 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  32.69 
 
 
257 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  32.69 
 
 
257 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  36.96 
 
 
256 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 
249 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  32.69 
 
 
257 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.76 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  32.69 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  34.12 
 
 
248 aa  125  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  40.8 
 
 
253 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>