More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2162 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
261 aa  505  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  50.97 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  51.72 
 
 
261 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  48.26 
 
 
261 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  50.19 
 
 
261 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  50.19 
 
 
261 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  47.51 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  47.88 
 
 
261 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  45.04 
 
 
254 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  41.54 
 
 
261 aa  191  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  46.33 
 
 
252 aa  185  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  41 
 
 
263 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  45.04 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  38.31 
 
 
258 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.68 
 
 
250 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
254 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  41.96 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
258 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2435  transcriptional regulator, DeoR family  42.75 
 
 
253 aa  148  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0079946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
274 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.98 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  34.21 
 
 
257 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  33.83 
 
 
257 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  33.83 
 
 
257 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  33.83 
 
 
257 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  33.83 
 
 
257 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 
257 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  38.87 
 
 
266 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  34.47 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.82 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.84 
 
 
260 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.53 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.69 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.69 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.69 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.69 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.69 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.69 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.69 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  38.52 
 
 
278 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  32.57 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  32.57 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24390  transcriptional regulator of sugar metabolism  37.89 
 
 
284 aa  135  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  35.55 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  40.98 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.4 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.08 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.31 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  31.39 
 
 
263 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  38.52 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  36.09 
 
 
276 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  31.85 
 
 
257 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 
258 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  31.85 
 
 
257 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
257 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  31.85 
 
 
257 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.06 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  31.71 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  31.85 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.06 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  36.07 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.06 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  37.16 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.51 
 
 
252 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.51 
 
 
252 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  35.95 
 
 
290 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.51 
 
 
252 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  34.22 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  32.1 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  32.1 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
252 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.84 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.84 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  34.47 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.84 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.84 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.84 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3160  DeoR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
296 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  34.09 
 
 
257 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 
252 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  28.96 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  34.48 
 
 
266 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
256 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>