More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5063 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  497  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  84.46 
 
 		 251 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  84.46 
 
 		 251 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  73.31 
 
 		 252 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  71.31 
 
 		 252 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  72.51 
 
 		 252 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  72.51 
 
 		 252 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  72.51 
 
 		 252 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  71.31 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  71.31 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 407 aa  361  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 252 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 252 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 252 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 252 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 252 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 252 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  70.12 
 
 		 348 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  61.35 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  44 
 
 		 288 aa  205  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  34.41 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.16 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  34.16 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.16 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.16 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.16 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  34.16 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.54 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.16 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.16 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.16 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  36.21 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  34.16 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3160  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.71 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.54 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.54 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.12 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.71 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.71 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.71 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.74 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.74 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.74 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.74 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  35.69 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.88 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.23 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.89 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.89 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  35.57 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  34.48 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  37.08 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  35.81 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  32.23 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  36.07 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  36.07 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  34.89 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  34.62 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  34.68 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  34.77 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.87 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  34.02 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3321  DeoR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  34.19 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.05 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  34.29 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 277 aa  121  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>