More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5344 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  64.17 
 
 		 266 aa  308  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  62.4 
 
 		 263 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  61.81 
 
 		 266 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  59.38 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  54.72 
 
 		 282 aa  275  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  56.25 
 
 		 289 aa  271  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  56.3 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32750  transcriptional regulator, DeoR family  50.58 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  49.43 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 263 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  56.18 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  52.11 
 
 		 262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  53.51 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  45.3 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 254 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3470  transcriptional regulator, DeoR family  47.3 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  44.92 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  39.66 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 		 260 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 256 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  40.62 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  35.43 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  33.73 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.54 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  38.98 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.54 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.54 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.54 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.54 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.54 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.54 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.52 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  35.2 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  35.77 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.75 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  40.23 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.14 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  38.52 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  34.57 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 257 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.28 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  38.3 
 
 		 253 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.28 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.98 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.66 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  37.8 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  39.51 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  32.54 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 255 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.8 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  32.8 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  32.8 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  30.04 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  36.92 
 
 		 252 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  36.96 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  36.47 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.25 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4348  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  32.8 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  36.12 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4141  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  35.25 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  35.25 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  39.9 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  31.23 
 
 		 252 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>