More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0995 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  49.2 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  49.2 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  46.67 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  47.2 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  47.2 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  47.2 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  47.2 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  47.2 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  47.2 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  47.2 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  44.53 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  43.7 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  41.94 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  38.74 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.55 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.35 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.35 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.35 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.35 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.35 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  36.14 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  36.14 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.14 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  36.14 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.14 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.14 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.14 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.14 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  37.5 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.65 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  35.71 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001644  transcriptional regulator of GlmS, DeoR family  37.7 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00296274  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  39.52 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  38.19 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  38.19 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  38.19 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  38.19 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  35.46 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  38.8 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0038  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.69 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00830  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3744  regulatory protein, DeoR  37.01 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  38 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 266 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.84 
 
 		 250 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  35.29 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0673  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.58 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4041  transcriptional regulator, DeoR family protein  36.82 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  36.22 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  38.94 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  35.69 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  35.69 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  35.69 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  35.69 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  34.19 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  35.69 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  36.65 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4603  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5197  DeoR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.342459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>