More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1079 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  57.71 
 
 
253 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
258 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  39.44 
 
 
250 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  40.73 
 
 
254 aa  175  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.77 
 
 
260 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.19 
 
 
267 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  41.49 
 
 
254 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.05 
 
 
258 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
255 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
255 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 
257 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
255 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
255 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  38.11 
 
 
253 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  39.06 
 
 
253 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
265 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  35.42 
 
 
253 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  38.75 
 
 
258 aa  158  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
264 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  34.68 
 
 
260 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
259 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
253 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
260 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.28 
 
 
253 aa  155  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
253 aa  155  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  38.27 
 
 
252 aa  154  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 
256 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  40.08 
 
 
255 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  33.47 
 
 
252 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 
255 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  33.47 
 
 
252 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
288 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.47 
 
 
252 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.47 
 
 
252 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  35.2 
 
 
282 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.22 
 
 
253 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.47 
 
 
252 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.47 
 
 
252 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.47 
 
 
252 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.67 
 
 
252 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.47 
 
 
252 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.67 
 
 
252 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.67 
 
 
252 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.67 
 
 
252 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 
290 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 
252 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 
266 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  37.9 
 
 
253 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 
264 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.35 
 
 
252 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 
254 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
257 aa  148  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  34.16 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  31.58 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 
252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.22 
 
 
257 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  38.7 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 
252 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
264 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
253 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.62 
 
 
269 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.91 
 
 
269 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  34.12 
 
 
257 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.27 
 
 
252 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.35 
 
 
252 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.62 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.3 
 
 
257 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
257 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  33.62 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 
266 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.62 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.3 
 
 
257 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.62 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.62 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.62 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  35.68 
 
 
252 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  39.3 
 
 
257 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  39.3 
 
 
257 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  39.3 
 
 
257 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.3 
 
 
257 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.27 
 
 
252 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.3 
 
 
257 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.27 
 
 
252 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
242 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.27 
 
 
252 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.3 
 
 
257 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
269 aa  141  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  34.04 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>