More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2797 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  83.92 
 
 		 255 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  48.21 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  47.01 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  42.37 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  41.37 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  36.9 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  35.71 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  35.71 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  38.55 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  39.68 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  38.98 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.67 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.67 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  38.67 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  38.67 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.67 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  38.67 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.67 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.97 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.89 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.28 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  34.96 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  38.24 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  36.75 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.11 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.11 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.11 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.11 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.72 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  31.13 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 254 aa  141  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  37.17 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  31.52 
 
 		 289 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  32.3 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  34.11 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  32.53 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  36.51 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  31.42 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  38.1 
 
 		 252 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.87 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.87 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.27 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  32.56 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  34.5 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.37 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.73 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  31.64 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5218  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.439257 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  33.73 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5481  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.21489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>