More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5798 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
252 aa  484  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  54.18 
 
 
254 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  53.2 
 
 
258 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  50.2 
 
 
256 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  46.12 
 
 
261 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  48.06 
 
 
261 aa  205  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  45.35 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  50.78 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  46.51 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  46.51 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
261 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
261 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  46.33 
 
 
261 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  44.62 
 
 
278 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2435  transcriptional regulator, DeoR family  44.8 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0079946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  42.63 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  41.2 
 
 
267 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  34.65 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  34.96 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  43.72 
 
 
264 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  41.6 
 
 
253 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
251 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
257 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  42.46 
 
 
258 aa  158  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
256 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  37.92 
 
 
253 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  37.94 
 
 
260 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  38.52 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 
267 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  34.66 
 
 
255 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  41.04 
 
 
253 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  40 
 
 
258 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  41.77 
 
 
267 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
261 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
261 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  34 
 
 
254 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
261 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  37.83 
 
 
266 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  39.84 
 
 
258 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  35.37 
 
 
254 aa  149  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 
256 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.74 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  35.74 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.74 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.74 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.74 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.74 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.74 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  36.25 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.1 
 
 
257 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.94 
 
 
269 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  32 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.76 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  32 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
254 aa  145  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 
252 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.13 
 
 
250 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  42.5 
 
 
266 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  37.97 
 
 
282 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6108  DeoR family transcriptional regulator  43.46 
 
 
268 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  40.59 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  34.82 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.6 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.6 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
253 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  38.49 
 
 
256 aa  138  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
256 aa  138  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 
253 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 
257 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
294 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  37.83 
 
 
256 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
256 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
266 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 
252 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
264 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.14 
 
 
251 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.14 
 
 
251 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  41.18 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.4 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.17 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.17 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.93 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24390  transcriptional regulator of sugar metabolism  37.94 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>