More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7075 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  73.41 
 
 		 253 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  72.33 
 
 		 253 aa  361  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  73.12 
 
 		 253 aa  351  5.9999999999999994e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 253 aa  338  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  68 
 
 		 253 aa  337  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  60.08 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  56.92 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  58.89 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  54.55 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  54.94 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  50.2 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  45.45 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 259 aa  207  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  48.83 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  42.54 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  45.53 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  42.06 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  37.8 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  39.74 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  35.93 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  38.82 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  38.82 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  42.02 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.98 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  38.82 
 
 		 282 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  34.85 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  31.33 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  37.98 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1218  regulatory protein DeoR  44.69 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658243  decreased coverage  0.00388066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  39.24 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  38.34 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  36.96 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  38.79 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  36.05 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  36.05 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  39.25 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  30.89 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  36.05 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  37.92 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.95 
 
 		 259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 294 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  38.82 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  33.2 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2819  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0209675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  38.18 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  37.97 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2578  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000422866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2765  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  40.59 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32.63 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>