More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2043 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
267 aa  532  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
269 aa  285  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  50.4 
 
 
261 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  47.95 
 
 
283 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  45.7 
 
 
262 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  37.25 
 
 
257 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  38 
 
 
258 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
260 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  38.56 
 
 
253 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
274 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  36.72 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.9 
 
 
258 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  36.22 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.9 
 
 
250 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
256 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  37.3 
 
 
282 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  38.52 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  38.63 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
264 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
256 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 
253 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
257 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
264 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  31.87 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.77 
 
 
254 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.13 
 
 
266 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  35.17 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
267 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  30.68 
 
 
263 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
260 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.11 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  36.55 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  35.16 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 
254 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
254 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.76 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  33.73 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.28 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  34.54 
 
 
267 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  34.24 
 
 
260 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  34.46 
 
 
275 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 
257 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34.54 
 
 
253 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  32.56 
 
 
255 aa  125  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.76 
 
 
265 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  31.76 
 
 
265 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
254 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
258 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  34.65 
 
 
259 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
254 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  32.42 
 
 
255 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
254 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 
253 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 
263 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 
254 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
254 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.96 
 
 
269 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  33.07 
 
 
258 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
271 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  37.94 
 
 
253 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 
254 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.26 
 
 
269 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 
253 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.2 
 
 
258 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
261 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.26 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.26 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.26 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.26 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.26 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.26 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  34.58 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.26 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  31.49 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  29.43 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  31.45 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  34.26 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  34.26 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>