More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4407 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  99.6 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
254 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.19 
 
 
258 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 
257 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
309 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
253 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 
253 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
282 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.19 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  34.03 
 
 
251 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  32.33 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 
255 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  33.91 
 
 
275 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 
258 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
253 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 
253 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
254 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  31.51 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
348 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  30.9 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2534  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000015777  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 
253 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
251 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  31.65 
 
 
254 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
264 aa  118  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2404  transcriptional regulator, DeoR family  34.33 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.494443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  31.49 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.53 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  34.41 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  31.38 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  34.16 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  34.16 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  34.16 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  34.16 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
251 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
252 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
258 aa  115  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  34.16 
 
 
257 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
263 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  33.02 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  32.32 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2567  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  32.03 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  31.76 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  33.62 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  32.76 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  32.31 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
251 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
251 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  32.76 
 
 
248 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
257 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
255 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  32.47 
 
 
256 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  31.65 
 
 
248 aa  112  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
255 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
255 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  31.87 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  30.51 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>