More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1218 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1218  regulatory protein DeoR  100 
 
 		 205 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658243  decreased coverage  0.00388066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  50.29 
 
 		 253 aa  144  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  44.69 
 
 		 253 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  43.58 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  44.69 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  47.31 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  42.59 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  39.56 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  41.32 
 
 		 256 aa  111  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  44.91 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 255 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 255 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 255 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 253 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  38.15 
 
 		 255 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.37 
 
 		 267 aa  101  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 259 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 254 aa  95.5  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.58 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 		 269 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 264 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 268 aa  88.2  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.32 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  33.53 
 
 		 253 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 258 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 252 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  38.64 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  32.95 
 
 		 252 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  31.68 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  29.82 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  35.48 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  29.61 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  31.79 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  35.03 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  25.6 
 
 		 259 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 266 aa  74.7  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  26.74 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  29.79 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  25.12 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  25.12 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  25.12 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  25.12 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 256 aa  72  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  35.48 
 
 		 256 aa  72  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  32.72 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  25.49 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  36.43 
 
 		 253 aa  71.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  32.95 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2776  transcriptional regulator, DeoR family  27.43 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2578  DeoR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000422866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  27.59 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2765  DeoR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595912  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4630  DeoR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  38.36 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  33.12 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  29.55 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2819  transcriptional regulator, DeoR family  25.71 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0209675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2772  transcriptional regulator, DeoR family  26.29 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0124303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  27.75 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  24.87 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  27.75 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.59 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  32.03 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  24.87 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  24.87 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  28.75 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  27.75 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  27.75 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  24.87 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>