More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 253 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  63.24 
 
 		 253 aa  304  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  58.5 
 
 		 253 aa  289  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  58.5 
 
 		 253 aa  285  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  58.78 
 
 		 253 aa  278  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 253 aa  271  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  57.71 
 
 		 253 aa  271  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  55.56 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  56.92 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  58.89 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  50.39 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  51.17 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  51.84 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  49.36 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  45.15 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  46.27 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  42.24 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  38.19 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39.04 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  41.48 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  38.37 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  38.33 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  40.42 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  38.33 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  38.33 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  38.33 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.25 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  40.42 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  40.42 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  40.42 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  40.42 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  38.04 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  40.4 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  34.43 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.52 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  40.83 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  34.17 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  37.8 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  37.6 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  41.18 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  34.63 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  32.53 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  39.13 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  41.06 
 
 		 267 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 253 aa  141  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  36.67 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  40.65 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  41.35 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.78 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.78 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  34.78 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  34.78 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.78 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  38.56 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.78 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  34.78 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  41.84 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 		 266 aa  138  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>