More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0712 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  43.98 
 
 
254 aa  198  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  38.26 
 
 
250 aa  165  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
257 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  34.4 
 
 
254 aa  158  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 
260 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  34.59 
 
 
276 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 
257 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  34.11 
 
 
255 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 
264 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
254 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 
254 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
258 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 
266 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 
282 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.8 
 
 
258 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
253 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  36.75 
 
 
254 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  35.68 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  32.81 
 
 
258 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
258 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 
267 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  32.81 
 
 
258 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  37.5 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 
257 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  34.11 
 
 
255 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
255 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
255 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
255 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2894  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
265 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0151849 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 
252 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
271 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.48 
 
 
252 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
252 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
252 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  36.48 
 
 
252 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
252 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  38.19 
 
 
253 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 
248 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
260 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 
253 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
253 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.67 
 
 
253 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  36.48 
 
 
252 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 
263 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.65 
 
 
253 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.6 
 
 
269 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 
255 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.4 
 
 
269 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 
269 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 
269 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 
269 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.4 
 
 
269 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 
269 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  36.82 
 
 
275 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 
269 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  36.48 
 
 
252 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  36.25 
 
 
252 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
257 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
252 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 
256 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  36.13 
 
 
261 aa  141  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 
269 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 
257 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
252 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  34.6 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  34.11 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.02 
 
 
258 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 
257 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  31.75 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  36.6 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  34.44 
 
 
266 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  35.16 
 
 
254 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  39 
 
 
253 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  35.63 
 
 
262 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3204  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.05 
 
 
239 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
251 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
251 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
260 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 
253 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
265 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  37.18 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3124  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.05 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0169368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
267 aa  136  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  34.25 
 
 
253 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>