More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1446 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  38.26 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3405  DNA-binding transcriptional activator FucR  37.61 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  35.22 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4069  DNA-binding transcriptional activator FucR  37.66 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00240232  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02656  DNA-binding transcriptional activator  37.66 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0883  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2946  DNA-binding transcriptional activator FucR  37.66 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000344425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2949  DNA-binding transcriptional activator FucR  37.66 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000516509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3111  DNA-binding transcriptional activator FucR  37.66 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02617  hypothetical protein  37.66 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0907  DNA-binding transcriptional activator FucR  37.66 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3141  DNA-binding transcriptional activator FucR  36.96 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3204  DNA-binding transcriptional activator FucR  36.96 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3124  DNA-binding transcriptional activator FucR  36.52 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0169368  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3189  DNA-binding transcriptional activator FucR  36.52 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3304  DNA-binding transcriptional activator FucR  36.52 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  34.41 
 
 		 254 aa  144  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 		 252 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.08 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  32.08 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  31.71 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 253 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.43 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.92 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.67 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.84 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  30.9 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.23 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.23 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.23 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.23 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.23 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.04 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.23 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  29.75 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  31.8 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.22 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.23 
 
 		 269 aa  121  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  27.71 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.12 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.2 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32.16 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  27.98 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  32.94 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.2 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  32.94 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  32.94 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  32.94 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  32.94 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  35.4 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.72 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  29.55 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.72 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 265 aa  118  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 282 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0868  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  32.33 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0815  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  29.6 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.53 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  27.53 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  27.53 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>