More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0868 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0868  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0815  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2907  DeoR family transcriptional regulator  89.76 
 
 
262 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  73.91 
 
 
258 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  68.25 
 
 
258 aa  350  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  51.41 
 
 
261 aa  258  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  40.65 
 
 
287 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  40.17 
 
 
261 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13310  transcriptional regulator of sugar metabolism  40.16 
 
 
259 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
289 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32060  transcriptional regulator of sugar metabolism  38.43 
 
 
262 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 
280 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4074  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798271  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1511  transcriptional regulator, DeoR family  36.68 
 
 
280 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
274 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.25 
 
 
267 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  30.77 
 
 
250 aa  118  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.54 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 
248 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
254 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.03 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2986  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  25.9 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
258 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
267 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  26.88 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 
252 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 
258 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 
258 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
252 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.83 
 
 
252 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 
252 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  30.36 
 
 
254 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
252 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  30.83 
 
 
252 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
252 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
251 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  31.82 
 
 
257 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 
253 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
258 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.27 
 
 
269 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 
269 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 
252 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  27.27 
 
 
269 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.27 
 
 
269 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.27 
 
 
269 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  30.08 
 
 
263 aa  105  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.27 
 
 
269 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
252 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.27 
 
 
269 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 
253 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.17 
 
 
269 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 
252 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.67 
 
 
269 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.27 
 
 
269 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 
255 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
256 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
256 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
256 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 
253 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  33.05 
 
 
259 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
255 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  33.05 
 
 
259 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
257 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  33.05 
 
 
257 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  33.05 
 
 
257 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.66 
 
 
253 aa  102  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  33.05 
 
 
257 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
257 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.77 
 
 
257 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4365  transcriptional regulator, DeoR family  32.31 
 
 
262 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
258 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
254 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  29.72 
 
 
257 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 
262 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
274 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  26.09 
 
 
257 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  27.23 
 
 
257 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  31.27 
 
 
252 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.52 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  27.17 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  29.52 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  29.52 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  27.17 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.17 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.17 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.17 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.17 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.17 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  27.95 
 
 
252 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>