More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5327 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2907  DeoR family transcriptional regulator  75.79 
 
 		 262 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0868  DeoR family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 254 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0815  DeoR family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 254 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 258 aa  349  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 261 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  41.87 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4074  transcriptional regulator, DeoR family  35.6 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798271  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  38.1 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  39.32 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13310  transcriptional regulator of sugar metabolism  39.76 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32060  transcriptional regulator of sugar metabolism  38.84 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1511  transcriptional regulator, DeoR family  36.68 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 273 aa  148  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  29.55 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  26.69 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  36.14 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  31.64 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  31.85 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.93 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  27.38 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  26.46 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.69 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.09 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.09 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.69 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.09 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.69 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2986  DeoR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247134  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.09 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.69 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  26.09 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.09 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  26.09 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.09 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.12 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.69 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  26.09 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  29.69 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.69 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.69 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  30.27 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.79 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  29.79 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.96 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  28.16 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.3 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  31.02 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  29.22 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  32.68 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  29.41 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  28.85 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  31.44 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  26.07 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  24.9 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.3 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>