More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3405 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3405  DNA-binding transcriptional activator FucR  100 
 
 
238 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02656  DNA-binding transcriptional activator  64.22 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0883  transcriptional regulator, DeoR family  64.22 
 
 
243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3111  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.22 
 
 
243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2946  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.22 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000344425  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0907  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.22 
 
 
243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2949  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.22 
 
 
243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000516509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02617  hypothetical protein  64.22 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4069  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.22 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00240232  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3204  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.81 
 
 
239 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3141  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.81 
 
 
236 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3304  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.81 
 
 
236 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3189  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.81 
 
 
236 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3124  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.81 
 
 
239 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0169368  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  37.61 
 
 
250 aa  160  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 
258 aa  135  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  34.17 
 
 
276 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.77 
 
 
252 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  32.49 
 
 
252 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
252 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 
252 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
252 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  32.77 
 
 
252 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
262 aa  118  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  29.79 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  30.9 
 
 
248 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  30.9 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1565  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  32.19 
 
 
254 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
269 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  33.02 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  29.66 
 
 
255 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 
257 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 
251 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.43 
 
 
261 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  27.43 
 
 
261 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
266 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
261 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  27.43 
 
 
261 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  27.43 
 
 
269 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
274 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
260 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  30.54 
 
 
253 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  27 
 
 
261 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.43 
 
 
252 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  30.17 
 
 
259 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
257 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  30.17 
 
 
257 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 
257 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  30.17 
 
 
257 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  30.17 
 
 
259 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  30.17 
 
 
257 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  27.35 
 
 
263 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  30.93 
 
 
290 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  32.34 
 
 
258 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  27.35 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.23 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30.99 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.23 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2674  DeoR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  29.66 
 
 
252 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.23 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 
276 aa  99  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.23 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.23 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  27.9 
 
 
259 aa  98.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  26.81 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  27.23 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
254 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32.47 
 
 
267 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  26.81 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.38 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.81 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.38 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.38 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.38 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  25.85 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.38 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  29.29 
 
 
282 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  28.69 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4348  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  27.97 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4141  DeoR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  31.66 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4102  DeoR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  28.21 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>