More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3111 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0883  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0907  DNA-binding transcriptional activator FucR  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2949  DNA-binding transcriptional activator FucR  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000516509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3111  DNA-binding transcriptional activator FucR  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02656  DNA-binding transcriptional activator  99.59 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4069  DNA-binding transcriptional activator FucR  99.59 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00240232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02617  hypothetical protein  99.59 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2946  DNA-binding transcriptional activator FucR  99.59 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000344425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3204  DNA-binding transcriptional activator FucR  89.36 
 
 		 239 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3141  DNA-binding transcriptional activator FucR  89.36 
 
 		 236 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3124  DNA-binding transcriptional activator FucR  88.94 
 
 		 239 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0169368  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3304  DNA-binding transcriptional activator FucR  88.51 
 
 		 236 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3189  DNA-binding transcriptional activator FucR  88.94 
 
 		 236 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3405  DNA-binding transcriptional activator FucR  64.22 
 
 		 238 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  37.66 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  32.9 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  32.03 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  29.18 
 
 		 283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  29.31 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  29.61 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  28.76 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.6 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.26 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  30.51 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.26 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.26 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.26 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.26 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  29.74 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.26 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  30.67 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  25.21 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  28.02 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  28.02 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  30.57 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.26 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.7 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  30.43 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  29.95 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  32.78 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.47 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0380  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  27.78 
 
 		 256 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  30.47 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  28.16 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.83 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3571  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.7 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  28.7 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 270 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  28.7 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  28.7 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.83 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  28.75 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.83 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  32.74 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  27.9 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  27.88 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  28.14 
 
 		 282 aa  95.5  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.64 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 274 aa  95.5  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.64 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  27.83 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  30.93 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  30.51 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>