More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2172 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
270 aa  538  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8218  transcriptional regulator, DeoR family  43.21 
 
 
263 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437389  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  39.24 
 
 
257 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 
253 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
263 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 
253 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 
253 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  36.19 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  35.39 
 
 
263 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
274 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 
266 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.21 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.4 
 
 
258 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32.43 
 
 
267 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  37.21 
 
 
255 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
266 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
253 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.04 
 
 
252 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  37.16 
 
 
261 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
257 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
269 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
264 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  34.73 
 
 
257 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.04 
 
 
252 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.64 
 
 
258 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
253 aa  122  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  33.19 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.19 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.19 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  33.19 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.62 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.19 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.19 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.19 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.19 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  38.55 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.69 
 
 
257 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.13 
 
 
252 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  38.17 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  33.33 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.73 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.73 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.73 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.73 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
252 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.73 
 
 
252 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  35.6 
 
 
270 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  33.98 
 
 
264 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  32.91 
 
 
263 aa  118  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.19 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.19 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  34.21 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.53 
 
 
252 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
256 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 
252 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 
289 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
259 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  37.29 
 
 
253 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 
254 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.91 
 
 
252 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  32.05 
 
 
263 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
261 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.91 
 
 
252 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.91 
 
 
252 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  29.8 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  29.72 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  29.49 
 
 
256 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  32.65 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  35.54 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  36.43 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.19 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  28.06 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 
259 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  36.92 
 
 
254 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
257 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  28.24 
 
 
255 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  35.98 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.91 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  34.77 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  38.28 
 
 
252 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
252 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 
256 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  36.1 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  34.11 
 
 
262 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
269 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2499  transcriptional regulator, DeoR family  33.61 
 
 
258 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>