More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1675 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  35.51 
 
 
254 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 
260 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
265 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
266 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6108  DeoR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  34.6 
 
 
262 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
254 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2591  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.759776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  32.13 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5960  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6957  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1531  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6298  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.7128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.52 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  31 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  31.74 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 
252 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  31.35 
 
 
257 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  29.44 
 
 
255 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  28.69 
 
 
270 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
254 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.2 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  32.66 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  34.24 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  30.28 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 
254 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
253 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  27.56 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  27.09 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  31.49 
 
 
257 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  26.42 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.96 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 
254 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  29.67 
 
 
262 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  29.82 
 
 
255 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  31 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  30.98 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1951  DeoR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.485525  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  29.25 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  29.25 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  29.25 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  29.25 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  29.25 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  33.47 
 
 
258 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  28 
 
 
250 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  28.79 
 
 
256 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  30.36 
 
 
252 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2441  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
267 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00165054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  29.79 
 
 
252 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4674  DeoR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  32.33 
 
 
233 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  28 
 
 
254 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  29.17 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  27.64 
 
 
259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 
257 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 
257 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
257 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  29.25 
 
 
275 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
259 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
252 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  26.91 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.42 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>