More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3326 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 257 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  99.22 
 
 		 257 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  93.44 
 
 		 261 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 254 aa  295  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  60.73 
 
 		 259 aa  291  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  56.92 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  57.71 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  59.13 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  58 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  57.54 
 
 		 254 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  57.2 
 
 		 278 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  57.2 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  57.2 
 
 		 278 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  57.2 
 
 		 278 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  57.2 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  57.2 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  57.2 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  57.2 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 294 aa  278  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 259 aa  271  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 294 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  54.8 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  53.75 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  54.8 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  51.82 
 
 		 263 aa  261  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  49.81 
 
 		 263 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  53.75 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  50 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  52.7 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  52.7 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  53.94 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  54.47 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  53.53 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  52.26 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3832  DeoR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 277 aa  242  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3677  DeoR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 254 aa  240  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.488324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  49.39 
 
 		 252 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  49.39 
 
 		 252 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  49.39 
 
 		 252 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  47.2 
 
 		 252 aa  238  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1769  DeoR family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 265 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.125805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 263 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  44.49 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 252 aa  235  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.33 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.33 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.33 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.33 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  51.48 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  47.92 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.92 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.92 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  47.92 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  47.92 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.18 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.77 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  49.4 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  46 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  49 
 
 		 314 aa  228  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.18 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.18 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.5 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.5 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2180  DeoR family transcriptional regulator  48 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.5 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.5 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.08 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 260 aa  225  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.75 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  46.43 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  47.6 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  49.2 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  49.38 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  50 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  43.78 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  49.15 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>