More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1360 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
274 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  87.74 
 
 
284 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  88.26 
 
 
266 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  87.12 
 
 
265 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  83.73 
 
 
277 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  67.7 
 
 
260 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  67.47 
 
 
267 aa  338  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  63.35 
 
 
256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  61.69 
 
 
254 aa  318  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  62.15 
 
 
263 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  61.69 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  59.62 
 
 
263 aa  311  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  62.1 
 
 
257 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  59.62 
 
 
314 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  61.69 
 
 
257 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  64.11 
 
 
253 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  58.06 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  54.1 
 
 
254 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  52.46 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  49.6 
 
 
259 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  49.6 
 
 
259 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  49.6 
 
 
253 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50.2 
 
 
257 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50 
 
 
278 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50 
 
 
278 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  49.2 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  50 
 
 
259 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  50 
 
 
294 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  49.6 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  49.6 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  49.2 
 
 
259 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  52.08 
 
 
256 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  52.59 
 
 
252 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  48.4 
 
 
259 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  48.8 
 
 
259 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
251 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  48.73 
 
 
256 aa  225  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  48.39 
 
 
251 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  51.97 
 
 
251 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  49.38 
 
 
251 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  48.58 
 
 
286 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
251 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
251 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  47.98 
 
 
257 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  45.27 
 
 
255 aa  222  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  48.07 
 
 
275 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  48.95 
 
 
259 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  49.36 
 
 
261 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  44.03 
 
 
263 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2180  DeoR family transcriptional regulator  46.22 
 
 
273 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.31 
 
 
252 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  46.85 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
256 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44.94 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  46.85 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44.94 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  43.7 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  43.9 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  49.34 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.4 
 
 
252 aa  211  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.42 
 
 
252 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.42 
 
 
252 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.42 
 
 
252 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
253 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  43.5 
 
 
252 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  43.5 
 
 
252 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.4 
 
 
252 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  43.09 
 
 
252 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  42.97 
 
 
252 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.28 
 
 
252 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.28 
 
 
252 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.28 
 
 
252 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.28 
 
 
252 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  45.02 
 
 
259 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.86 
 
 
252 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.86 
 
 
252 aa  204  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.86 
 
 
252 aa  204  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.86 
 
 
252 aa  204  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  42.86 
 
 
252 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  42.86 
 
 
252 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2205  DeoR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
264 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.86 
 
 
252 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  46.5 
 
 
254 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3832  DeoR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
277 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.86 
 
 
252 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  47.68 
 
 
254 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  40.82 
 
 
270 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  45.56 
 
 
257 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1769  DeoR family transcriptional regulator  47.01 
 
 
265 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.125805  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  41.32 
 
 
252 aa  202  6e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  46.37 
 
 
254 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  48.05 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>