More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0660 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
254 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  44.31 
 
 
254 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1070  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 
256 aa  191  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1936  transcriptional regulator, DeoR family  43.5 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000701948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
274 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  33.05 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  33.05 
 
 
252 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  33.05 
 
 
252 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  27.34 
 
 
256 aa  118  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  29.32 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  32.1 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.4 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 
259 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  30.84 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  29.65 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  27.31 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.02 
 
 
252 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
266 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.02 
 
 
252 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  29.07 
 
 
260 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  29.62 
 
 
253 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.02 
 
 
252 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  31.02 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  26.54 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  29.17 
 
 
257 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.24 
 
 
252 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  27.71 
 
 
263 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  26 
 
 
260 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  31.01 
 
 
250 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.24 
 
 
252 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
254 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  27.45 
 
 
267 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.84 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  30.57 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
250 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  30.23 
 
 
252 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
283 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
250 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
250 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
250 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
250 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 
250 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  33.48 
 
 
233 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  26.49 
 
 
268 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 
252 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
253 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
250 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
260 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.22 
 
 
257 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 
254 aa  105  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  29.95 
 
 
259 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
267 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
252 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  27.78 
 
 
255 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  25.59 
 
 
253 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 
250 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.46 
 
 
252 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.46 
 
 
252 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
288 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
253 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  27.08 
 
 
253 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
266 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  25.98 
 
 
261 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
251 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  33.72 
 
 
254 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  28.64 
 
 
254 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  29.23 
 
 
249 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
252 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
252 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
255 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
266 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
252 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
255 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
252 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
255 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
262 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 
260 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
258 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
251 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
256 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  25.1 
 
 
253 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 
260 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  30.48 
 
 
253 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.13 
 
 
253 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
256 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  26.15 
 
 
252 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 
250 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>