More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1936 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1936  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
253 aa  494  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000701948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1070  transcriptional regulator, DeoR family  43.2 
 
 
256 aa  198  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  42.29 
 
 
254 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  43.5 
 
 
255 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
254 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  28.46 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
254 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  34.07 
 
 
267 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 
252 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
256 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 
261 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
252 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  36.1 
 
 
257 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  26.48 
 
 
254 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
265 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.89 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  31.89 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.79 
 
 
253 aa  120  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  24.41 
 
 
258 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  27.67 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
268 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  27.56 
 
 
257 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  25.39 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
251 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  26.59 
 
 
268 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 
253 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.38 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  27.13 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.38 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.17 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  28.94 
 
 
253 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
251 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  28 
 
 
250 aa  113  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  26.67 
 
 
253 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
254 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  29.27 
 
 
258 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.51 
 
 
252 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.74 
 
 
252 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.74 
 
 
252 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.74 
 
 
252 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 
267 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  31.62 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.74 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.74 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  29.44 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.5 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  25.4 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
315 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
263 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.11 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  30.3 
 
 
252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.11 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  29.51 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.11 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.2 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.11 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  30.24 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>