More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4954 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
283 aa  552  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  51.75 
 
 
269 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  53.15 
 
 
261 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  47.95 
 
 
267 aa  208  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  44.08 
 
 
262 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.71 
 
 
267 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  35.14 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  37.1 
 
 
282 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  37.73 
 
 
260 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
260 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
265 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.15 
 
 
258 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
256 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.95 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  34.48 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  33.9 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  31.47 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.85 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3141  DNA-binding transcriptional activator FucR  30.04 
 
 
236 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3204  DNA-binding transcriptional activator FucR  30.04 
 
 
239 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
273 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3189  DNA-binding transcriptional activator FucR  30.04 
 
 
236 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3124  DNA-binding transcriptional activator FucR  30.04 
 
 
239 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0169368  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.19 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3304  DNA-binding transcriptional activator FucR  30.04 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.8 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.8 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.8 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  36.08 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  36.91 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  33.86 
 
 
257 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
258 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.58 
 
 
253 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  33.86 
 
 
257 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  33.86 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  33.86 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  33.86 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4069  DNA-binding transcriptional activator FucR  29.18 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00240232  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2946  DNA-binding transcriptional activator FucR  29.18 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000344425  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.6 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0883  transcriptional regulator, DeoR family  29.18 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  30.83 
 
 
250 aa  112  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0907  DNA-binding transcriptional activator FucR  29.18 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2949  DNA-binding transcriptional activator FucR  29.18 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000516509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3111  DNA-binding transcriptional activator FucR  29.18 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02656  DNA-binding transcriptional activator  29.18 
 
 
243 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02617  hypothetical protein  29.18 
 
 
243 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1936  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000701948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  32.56 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
269 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
256 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  30.15 
 
 
276 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  30.92 
 
 
254 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 
253 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
253 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
269 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  32.64 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.4 
 
 
257 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  36.45 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  34.51 
 
 
260 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  32.81 
 
 
257 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  32.81 
 
 
259 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
253 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
255 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  32.81 
 
 
257 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  32.81 
 
 
257 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
252 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
257 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
255 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
254 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 
254 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  33.73 
 
 
259 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
258 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  32.02 
 
 
251 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13310  transcriptional regulator of sugar metabolism  36.59 
 
 
259 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  26.48 
 
 
254 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
252 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 
266 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>