More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0242 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
262 aa  521  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  44.58 
 
 
261 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  44.4 
 
 
269 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  44.08 
 
 
283 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  45.7 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  36.94 
 
 
262 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.17 
 
 
258 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
264 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 
266 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.2 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  31.91 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.82 
 
 
258 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
260 aa  118  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  31.98 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.47 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  32.48 
 
 
267 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 
282 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
288 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.24 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  34.89 
 
 
257 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
267 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  35.57 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
267 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  33.19 
 
 
261 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  32.29 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  34.43 
 
 
252 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  34.32 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  34.91 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  29.82 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  32.56 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  30.13 
 
 
252 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  30.13 
 
 
252 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
263 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  31.42 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  30.13 
 
 
252 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 
261 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 
261 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  30.54 
 
 
250 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
250 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
250 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  30.54 
 
 
250 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
250 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  32.94 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.91 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  32.94 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  32.94 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  32.94 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.91 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.91 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.91 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.91 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  32.94 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  31.88 
 
 
290 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.27 
 
 
278 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  28.44 
 
 
250 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.27 
 
 
278 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 
253 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  33.95 
 
 
262 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  35.81 
 
 
261 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
261 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.93 
 
 
258 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  30.18 
 
 
245 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
254 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  32.07 
 
 
254 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
254 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.87 
 
 
249 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.51 
 
 
265 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2363  transcriptional regulator, DeoR family  28.87 
 
 
249 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2342  DeoR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
249 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.148271  hitchhiker  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  32.07 
 
 
254 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  31.51 
 
 
265 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1844  DeoR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
249 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000849222  hitchhiker  4.81659e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1396  DeoR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
249 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  32.1 
 
 
289 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1919  transcriptional regulator, DeoR family  28.87 
 
 
249 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00149597  hitchhiker  0.0000000000000423731 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  27.66 
 
 
257 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
256 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  35.27 
 
 
256 aa  106  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
256 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
256 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1515  transcriptional regulator, DeoR family  28.87 
 
 
249 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0337774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>