More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0131 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  41.83 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.8 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39.13 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  38.85 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34.51 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.29 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  36.22 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  37.75 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4943  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  36.05 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  35.55 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  35.55 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  33.6 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  35.43 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  36.72 
 
 		 253 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.63 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  37.15 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  33.72 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  37.28 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  34.68 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  34.68 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  33.6 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  34.68 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  34.92 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  37.15 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.27 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5727  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  35.77 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  38.08 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.27 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00830  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  37.94 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.27 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  39.41 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  32.03 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  35.34 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001644  transcriptional regulator of GlmS, DeoR family  32.53 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00296274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5197  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 258 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.342459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5596  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>