More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2958 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
262 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  57.09 
 
 
263 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  56.18 
 
 
290 aa  238  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  54.03 
 
 
266 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  56.75 
 
 
266 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  55.6 
 
 
260 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  51.74 
 
 
267 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  50.81 
 
 
282 aa  222  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  52.8 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  55.82 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  49.17 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
263 aa  195  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  53.71 
 
 
265 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  46.21 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32750  transcriptional regulator, DeoR family  45.42 
 
 
261 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19583  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
254 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3470  transcriptional regulator, DeoR family  47.95 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  40.4 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  44.87 
 
 
266 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  41.31 
 
 
237 aa  151  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.9 
 
 
257 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
264 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.22 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  40 
 
 
258 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
253 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  40.33 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  38.15 
 
 
267 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 
250 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
258 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  33.47 
 
 
258 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  33.47 
 
 
258 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
251 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
252 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
266 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  36.99 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  28.68 
 
 
257 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
268 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.15 
 
 
258 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.61 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  35.29 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  30.4 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  37.3 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  37 
 
 
269 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
262 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.61 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.61 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.61 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.61 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  31.47 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.61 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.61 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.61 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  31.47 
 
 
257 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  31.47 
 
 
257 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
251 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  31.47 
 
 
257 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.61 
 
 
269 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  31.87 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.28 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  31.87 
 
 
257 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  31.87 
 
 
257 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  31.87 
 
 
259 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  31.87 
 
 
257 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
257 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  39.84 
 
 
254 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  40.74 
 
 
255 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  38.49 
 
 
248 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  31.08 
 
 
257 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 
252 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
256 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  39.33 
 
 
258 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.97 
 
 
254 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
251 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  40.76 
 
 
261 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
253 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  32.14 
 
 
248 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
256 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.99 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  31.56 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
248 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
273 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
254 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  29.53 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  35.53 
 
 
252 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  36.02 
 
 
257 aa  118  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 
253 aa  118  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>