More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3135 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 265 aa  510  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  57.87 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  57.37 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  39.34 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  44.08 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  43.53 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 260 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  35.48 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  45.7 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  44.67 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  40.49 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  38.89 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 376 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  39.29 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  36.55 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  38.15 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  38.86 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  34.14 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  34.66 
 
 		 251 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  37.6 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  38.08 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  32.66 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  32.24 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  31.4 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1936  transcriptional regulator, DeoR family  28.46 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000701948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  27.89 
 
 		 253 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  28.51 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  31.91 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  28.11 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.12 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  32.95 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3442  transcriptional regulator, DeoR family  35.9 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000177835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1070  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  31.58 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  27.56 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  27.09 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  26.79 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  31.1 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.03 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.17 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.64 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  26.64 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.64 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  26.64 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.64 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.64 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.64 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  28.63 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  27.05 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  30.24 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  28.24 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  28.24 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  28.1 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  28.24 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  28.24 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.16 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>