More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4127 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  93.95 
 
 		 248 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  89.88 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  54.36 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  52.82 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  52.7 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  52.21 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  49.79 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  36.76 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  38.84 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  38.55 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  35.21 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  36.48 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  34 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  33.04 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  36.93 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  33.33 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  37.35 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  32.11 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  35.98 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  29.31 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  29.6 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  30.84 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  30 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  29.11 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 376 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  29.55 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  30.3 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  30.3 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  30.54 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  30.3 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  26.61 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  29.11 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  29.17 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  28.82 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  27.63 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  28.57 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  32.19 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  29.18 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 407 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  30.18 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>