More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0907 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  37.61 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  32.66 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  36.96 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  38.1 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  34.4 
 
 		 253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  36.68 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  35.34 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  39.89 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34.26 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 251 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  34.69 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  36.64 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  37.35 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1427  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.847076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  33.86 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  39.36 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  35.68 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  36.05 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  35.08 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  35.93 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  36.05 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  33.73 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.13 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  34.52 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  32.16 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  29.69 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  31.9 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4915  DeoR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  31 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  29 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  28.52 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  31.1 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  31 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  32.31 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  32.31 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  32.31 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>