More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0673 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  47.28 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  46.86 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  45.42 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  45.42 
 
 		 248 aa  221  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  45.19 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  42.26 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  44.58 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  43.1 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  35.27 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 231 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  29.29 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  32.23 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 270 aa  128  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  30.61 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  34.44 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  30.96 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  27.73 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  31.88 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  28.76 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  29.29 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 376 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  29.29 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  29.17 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  28.92 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  29.67 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  32.76 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0380  transcriptional regulator, DeoR family  31.4 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  29.46 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  28.16 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  27.05 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  28.38 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.16 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  26.75 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  26.16 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  26.16 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  26.16 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  27.16 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 288 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  26.97 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  27.71 
 
 		 250 aa  95.9  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  29.82 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  25.71 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  28.46 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  27.66 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>