More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2919 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  51.38 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  53.85 
 
 		 259 aa  262  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  46.48 
 
 		 257 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  42.34 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  42.74 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  38.43 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  39.21 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  38.65 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  34 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  37.17 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  37.39 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 		 251 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  33.78 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  33.78 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  35.11 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  32.24 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  35.04 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  33.93 
 
 		 247 aa  131  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  32.59 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  30.83 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  33.04 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  31.56 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  34.91 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  33.05 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  31.91 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8218  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.11 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.16 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  33.04 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  30.57 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.92 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  33.02 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  29.31 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  31.73 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  30.26 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  31.82 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.28 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  31 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  31.88 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  29.46 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.35 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  26.56 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  30.96 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  25.51 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  29.33 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.31 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>