More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4813 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  42.42 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  42.17 
 
 		 261 aa  184  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  41.1 
 
 		 249 aa  171  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  37.66 
 
 		 247 aa  171  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  39.15 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  37.45 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  39.66 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  38.1 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  36.6 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  38.63 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  37.66 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  35.65 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  32.61 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  34.78 
 
 		 253 aa  141  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 		 253 aa  138  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  29.57 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  32.9 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  30.7 
 
 		 251 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 250 aa  131  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 270 aa  131  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  32.3 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  28.7 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  30.49 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 376 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  29.07 
 
 		 258 aa  121  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 265 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  30.7 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  27.63 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 		 261 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  32.3 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  32.97 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  29.02 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  29.33 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  32.49 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  27.85 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  28.21 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  26.75 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  29.61 
 
 		 260 aa  108  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  29.79 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  30.43 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  27.19 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  27 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0380  transcriptional regulator, DeoR family  34.19 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  27.78 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  28.51 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  28.51 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  28.51 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  28.51 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  28.51 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>