More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1877 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  98.41 
 
 		 251 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  84.46 
 
 		 251 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  76.49 
 
 		 252 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  75.3 
 
 		 252 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  75.3 
 
 		 252 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  75.3 
 
 		 252 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  74.1 
 
 		 252 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  74.5 
 
 		 266 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  74.5 
 
 		 252 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 407 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 252 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 252 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 252 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 252 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 252 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 252 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 348 aa  362  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  62.55 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  46 
 
 		 288 aa  204  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.1 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  35.1 
 
 		 252 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  35.1 
 
 		 252 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.1 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.1 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.1 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.1 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.1 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.32 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.34 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  34.41 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  35.1 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.74 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.92 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.74 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.92 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.92 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.94 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  37.93 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.51 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.34 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  37.19 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.25 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.25 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.9 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.9 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.88 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  34.57 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.9 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.9 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  36.21 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  38.27 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  36.63 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.63 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.97 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 268 aa  131  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3160  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  35.9 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  35.97 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  35.51 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4141  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.52 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4348  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  31.98 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4102  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.71 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  31.71 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  31.71 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  31.71 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1769  DeoR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.125805  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  34.68 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  36.33 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  38.21 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>