More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1665 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  91.92 
 
 		 260 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3160  DeoR family transcriptional regulator  68.27 
 
 		 296 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0971  DeoR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  34.76 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  34.14 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.08 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.68 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.68 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.68 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.68 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 309 aa  141  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 284 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  34.2 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.68 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  30.68 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.68 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.68 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.68 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.68 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.68 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  30.68 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.23 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  34.55 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  36.18 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  30.28 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  34.54 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.56 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.55 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  35.97 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  30.77 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.54 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  131  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  34.55 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  36.9 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1769  DeoR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.125805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.37 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.14 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.14 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.14 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.14 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.14 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.89 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.14 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.89 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.89 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.14 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.89 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.89 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.37 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  34.44 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.37 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.47 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>