More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02920 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.31 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  31.46 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.46 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  31.46 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  31.46 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  34.51 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.04 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  37.94 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.28 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 		 261 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  34.77 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.44 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  34.92 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  32.45 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  32.95 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  33.2 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2180  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 273 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.08 
 
 		 251 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.08 
 
 		 251 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.98 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  36.09 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  32.28 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  32.28 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.4 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  30.23 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  29.18 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  33.75 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  33.97 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  31.37 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.06 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.06 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>