More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4986 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
260 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  91.92 
 
 
260 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3160  DeoR family transcriptional regulator  67.87 
 
 
296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  34.13 
 
 
278 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0971  DeoR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
251 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
252 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
259 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
251 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
252 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
348 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
251 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
259 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
252 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
252 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
252 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
257 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
252 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
252 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
284 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  34.14 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
286 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
294 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
252 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
259 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
252 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
266 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.14 
 
 
278 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
407 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  33.33 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
251 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
252 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  35.2 
 
 
258 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.36 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.69 
 
 
252 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.33 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  28.69 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  28.69 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.69 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.69 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.95 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.69 
 
 
252 aa  131  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.69 
 
 
252 aa  131  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.69 
 
 
252 aa  131  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  33.61 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  34.96 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.56 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.29 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  34.47 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  35.57 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  30.65 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.89 
 
 
252 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.89 
 
 
252 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.89 
 
 
252 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.89 
 
 
252 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.56 
 
 
252 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.56 
 
 
252 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
257 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  28.29 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.54 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.08 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.08 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.08 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.08 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.08 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  32.07 
 
 
261 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  35.74 
 
 
250 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.16 
 
 
252 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  35.34 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>