More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0682 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  51.04 
 
 
249 aa  262  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  49.79 
 
 
249 aa  258  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  49.79 
 
 
248 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  46.47 
 
 
247 aa  248  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  49.79 
 
 
248 aa  247  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  49.79 
 
 
248 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  49.17 
 
 
248 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  45.42 
 
 
258 aa  222  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
231 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  39.68 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  37.76 
 
 
249 aa  158  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  38.78 
 
 
252 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  36.07 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
254 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 
249 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 
261 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  32.89 
 
 
254 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
251 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
251 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  31.69 
 
 
253 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  33.86 
 
 
253 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34.55 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  34.71 
 
 
253 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  33.33 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 
248 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
270 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  31.74 
 
 
252 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  33.72 
 
 
253 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
261 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
255 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  34.31 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
348 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 
249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  32.24 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  29.75 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
253 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  30.33 
 
 
251 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
407 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  31.8 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
253 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  31.8 
 
 
264 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  27.05 
 
 
260 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 
253 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  31.17 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  31.17 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
251 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.65 
 
 
253 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  31.95 
 
 
257 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
251 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  29.83 
 
 
259 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
254 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
257 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  30.74 
 
 
252 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  31.49 
 
 
251 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  31.56 
 
 
258 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 
253 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  29.37 
 
 
257 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>