More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2155 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
278 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  47.01 
 
 
254 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  47.2 
 
 
258 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  44.62 
 
 
252 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  40.48 
 
 
256 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  40.47 
 
 
261 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  42.15 
 
 
261 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  38.22 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2435  transcriptional regulator, DeoR family  40.64 
 
 
253 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0079946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
261 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
261 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  39.29 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
254 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 
252 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  34.12 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  34.12 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.97 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  38.67 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 
261 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  33.46 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.05 
 
 
250 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
256 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0380  transcriptional regulator, DeoR family  31.98 
 
 
254 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  35.88 
 
 
261 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.17 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.17 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.17 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.01 
 
 
256 aa  129  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
251 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.17 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.17 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  36.55 
 
 
258 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  38.67 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
284 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 
257 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 
255 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  31.23 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  31.1 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
252 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  28.69 
 
 
254 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  33.19 
 
 
254 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
267 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
294 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.35 
 
 
267 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
290 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.35 
 
 
267 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.35 
 
 
267 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.35 
 
 
267 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
252 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.35 
 
 
267 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.06 
 
 
257 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 
262 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
259 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
253 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
294 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.87 
 
 
260 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 
253 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  32.61 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  32.61 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.61 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.61 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  35.68 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  32.61 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  28.45 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  38.91 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1159  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.04 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1565  transcriptional regulator, DeoR family  34.29 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  28.45 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 
253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.61 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.17 
 
 
257 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
259 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2591  DeoR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
258 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.759776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 
256 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.17 
 
 
257 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
259 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
257 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.26 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.26 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
259 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  29.72 
 
 
257 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4041  transcriptional regulator, DeoR family protein  33.99 
 
 
256 aa  119  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>