More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2802 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
257 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  34.17 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
260 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
260 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
260 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
260 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 
260 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
260 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
260 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 
260 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  31.52 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1053  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  30.43 
 
 
257 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  30.43 
 
 
257 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.43 
 
 
257 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.43 
 
 
257 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  30.43 
 
 
257 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.43 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.04 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.04 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  30.71 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.04 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.04 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  34.43 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.04 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.04 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.04 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.64 
 
 
257 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
257 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
252 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
254 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 
253 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
252 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 
258 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  30 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.84 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  30.56 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.53 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  30.16 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 
252 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 
252 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
257 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
255 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
255 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
274 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
255 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
252 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 
255 aa  118  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  29.69 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  31.23 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 
250 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.37 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  30.53 
 
 
254 aa  116  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2688  transcriptional regulator, DeoR family  30.59 
 
 
260 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
248 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  25.67 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  30.58 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.5 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  28.97 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  32.05 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  30.3 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2267  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 
259 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.481568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  29.3 
 
 
267 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 
289 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
266 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
258 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  29.13 
 
 
250 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  26.88 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  27.56 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  30.27 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  29.25 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  30.27 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>