More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.29 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  35.57 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  34.3 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.41 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  34.01 
 
 		 251 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.69 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  34.69 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  34.69 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  34.69 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.92 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.92 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.92 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.92 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.92 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 259 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.29 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.29 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.29 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.29 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.29 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.29 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  34.19 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.29 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  34.19 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  34.19 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.89 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4038  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  35.15 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.39 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  33.73 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.24 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  30.8 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  30.8 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3160  DeoR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  34.94 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  35.2 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 348 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  36.95 
 
 		 250 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.4 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.2 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  34.94 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>