More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1951 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1951  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.485525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2752  transcriptional regulator, DeoR family  38.82 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1041  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  35.34 
 
 		 289 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.52 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  35.75 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.1 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  30.56 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.34 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.34 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.68 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  34.04 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.74 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.74 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.74 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.34 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  34.4 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  33.82 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  34.25 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  32.63 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  28.34 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.34 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.34 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  28.34 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  30.71 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  34.22 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  31.15 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  29.08 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  36.36 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  27.17 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  39.57 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  34.41 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0868  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  28.4 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  33.92 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  31.39 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  28.35 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  30.28 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  35.55 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0815  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  27.94 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  32.24 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.34 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.76 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.76 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.76 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>