More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8218 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8218  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 263 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437389  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.16 
 
 		 250 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  38.01 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  38.06 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.76 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.17 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  39.68 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  37.56 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  35.59 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  37.55 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.87 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  35 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  35.5 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  28.39 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  38.91 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  36.7 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  27.85 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  29.83 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  35 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  35 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  34.16 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  32.18 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  37.07 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3321  DeoR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  31.35 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  34.91 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  30.3 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  34.96 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32.71 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  30.58 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  30.21 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  37.27 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  33.92 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  35.11 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  33.33 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  30.38 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.83 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  28.57 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  31.63 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>