More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2499 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2499  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 258 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2404  transcriptional regulator, DeoR family  79.07 
 
 		 258 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.494443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  69.77 
 
 		 256 aa  359  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  68.22 
 
 		 256 aa  351  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  50.39 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0219  DeoR family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 257 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2796  DeoR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 255 aa  208  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4915  DeoR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  37.07 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  34.32 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  33.19 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  36.6 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  35.45 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 		 252 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.03 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  32.63 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.03 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.03 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.76 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  35.85 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  34.03 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.24 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.8 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  37 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  32.91 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  32.91 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  32.19 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.11 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  30.4 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  32.92 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  32.63 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  30.4 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  32.91 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  37.08 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  31.71 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.25 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.25 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.96 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.25 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.25 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  31.56 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.96 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.25 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  30.24 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.34 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  31.56 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  31.93 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0130  regulatory protein, DeoR  29.71 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  31.06 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.34 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  28.99 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  31.97 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>