More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2594 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  67.19 
 
 		 253 aa  358  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4008  transcriptional regulator, DeoR family  51.38 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  42.57 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  42.17 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  41.77 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  36.25 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  35.86 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  34.66 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0971  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  28.16 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.3 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  34.78 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.93 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  32.76 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  34.6 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  34.19 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  35.07 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.37 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  32.91 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  31.94 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.35 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  29.1 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.98 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.78 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  31.96 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 268 aa  111  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.37 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  32.55 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.95 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.95 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.95 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  33.04 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.95 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  36.04 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.95 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  29.69 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.2 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  29.91 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.91 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.91 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.91 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  29.2 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  32.29 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  29.37 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.56 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 309 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>