More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2404 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2404  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
258 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.494443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2499  transcriptional regulator, DeoR family  79.07 
 
 
258 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  69.38 
 
 
256 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  67.83 
 
 
256 aa  347  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  52.33 
 
 
256 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  52.33 
 
 
256 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0219  DeoR family transcriptional regulator  52.12 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800116  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2796  DeoR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4915  DeoR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
260 aa  165  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
256 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.44 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  34.33 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  34.33 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  33.91 
 
 
252 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  35.42 
 
 
261 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
309 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  35.74 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  35.63 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.29 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  35.16 
 
 
253 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 
257 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  34.73 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.26 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  30.8 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  31.54 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.65 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.65 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.65 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.65 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  30.8 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.65 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  31.54 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.16 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 
248 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  32.2 
 
 
252 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.36 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3564  DeoR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
264 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0635844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
259 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  31.65 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
265 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
251 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.51 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.42 
 
 
252 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.42 
 
 
252 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.42 
 
 
252 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.42 
 
 
252 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
253 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.29 
 
 
257 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  35.39 
 
 
256 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.29 
 
 
257 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.29 
 
 
257 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.29 
 
 
257 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  32.49 
 
 
260 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
252 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  29.22 
 
 
257 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  29.22 
 
 
257 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 
260 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
260 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
260 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
260 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 
257 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.93 
 
 
253 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
266 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 
257 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  32.95 
 
 
282 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
260 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 
257 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  29.22 
 
 
257 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.87 
 
 
257 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 
257 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  34.21 
 
 
254 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 
260 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 
260 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  31.12 
 
 
258 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
253 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
260 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 
260 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
251 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 
257 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
260 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  31.51 
 
 
253 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.87 
 
 
257 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>