More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4915 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4915  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  43.85 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0219  DeoR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2499  transcriptional regulator, DeoR family  42.75 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  42.08 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2796  DeoR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  40.77 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2404  transcriptional regulator, DeoR family  39.31 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.494443  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  38.87 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.39 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.82 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.82 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.64 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  34.43 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  32.64 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  37.74 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.58 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  31.8 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  34.32 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1427  DeoR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.847076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  31.22 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  31.69 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  31.69 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  31.69 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  33.61 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  32.5 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  28.15 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  32.77 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  30.16 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  32.46 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  30.27 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  31.95 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  28.74 
 
 		 254 aa  101  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  31.93 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.8 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.49 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  31.7 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  31.36 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  31.4 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 253 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  31.19 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 268 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  29.11 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3442  transcriptional regulator, DeoR family  34.38 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000177835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  28.33 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2441  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00165054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  32.07 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  32.22 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  29.54 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0380  transcriptional regulator, DeoR family  26.64 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>