More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0512 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
256 aa  510  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  98.44 
 
 
256 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0219  DeoR family transcriptional regulator  82.49 
 
 
257 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800116  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2796  DeoR family transcriptional regulator  69.14 
 
 
255 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2499  transcriptional regulator, DeoR family  50.39 
 
 
258 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2404  transcriptional regulator, DeoR family  52.33 
 
 
258 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.494443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  49.61 
 
 
256 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  48.45 
 
 
256 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4915  DeoR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
256 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
256 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  37.29 
 
 
252 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.13 
 
 
250 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  35.46 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  35.15 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  35 
 
 
270 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  37.79 
 
 
255 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
255 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
255 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
255 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
259 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  37.92 
 
 
255 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  35.27 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 
257 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  32.64 
 
 
255 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
264 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  39.17 
 
 
256 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.18 
 
 
252 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  32.64 
 
 
263 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  35.12 
 
 
250 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  35.12 
 
 
250 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  35.12 
 
 
250 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
259 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.08 
 
 
257 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.63 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  37.34 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.63 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.63 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.63 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.63 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  35.83 
 
 
261 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
270 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  31.67 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.64 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  31.4 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.64 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.2 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.67 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.2 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.67 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.2 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.2 
 
 
252 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
251 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 
251 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
269 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
265 aa  118  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  118  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3564  DeoR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0635844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  31.93 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  34.31 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  35.39 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
253 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  33.19 
 
 
233 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 
254 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  32.2 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.89 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.89 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.89 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  32.78 
 
 
253 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  35.27 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  33.19 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  34.45 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.35 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  32.76 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  31.84 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  32.76 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>